03/30 CentOS 5.11のMySQL 5.0.95を5.6.23にアップグレードしたが動かない

CentOSサーバーにMoodleを入れようとしたのだが、OSがCentOS 5.11、PHP 5.3.3とMySQL 5.0.95と環境が古くてすんなりとインストールできない。CentOS 5.11は最新版だし、2017年まではサポートされる。問題だったのはMoodleではPHP 5.4.4以降、MySQL 5.5.31以降が必要というところ。PHPは割合簡単に5.6.7へアップグレードできた。MySQLのアップグレードでつまずいたのでメモを残しておく。

まず、古いMySQLと設定ファイルのバックアップを取る。

cd /var/lib
sudo cp -arp mysql mysql.backup
cd /etc
sudo cp my.cnf my.cnf.backup

古いMySQLを削除する。

rpm -qa | grep -i ^mysql
mysql-5.0.95-5.el5_9
mysql-server-5.0.95-5.el5_9
mysql-5.0.95-5.el5_9
sudo yum erase mysql-5.0.95-5.el5_9
Setting up Remove Process
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package mysql.i386 0:5.0.95-5.el5_9 set to be erased
--> Processing Dependency: mysql = 5.0.95-5.el5_9 for package: mysql-server
---> Package mysql.x86_64 0:5.0.95-5.el5_9 set to be erased
--> Processing Dependency: libmysqlclient.so.15()(64bit) for package: perl-DBD-MySQL
--> Processing Dependency: libmysqlclient.so.15(libmysqlclient_15)(64bit) for package: perl-DBD-MySQL
--> Running transaction check
---> Package mysql-server.x86_64 0:5.0.95-5.el5_9 set to be erased
---> Package perl-DBD-MySQL.x86_64 0:3.0007-2.el5 set to be erased
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved

==========================================================================================
 Package                 Arch            Version                 Repository          Size
==========================================================================================
Removing:
 mysql                   i386            5.0.95-5.el5_9          installed          8.0 M
 mysql                   x86_64          5.0.95-5.el5_9          installed          8.2 M
Removing for dependencies:
 mysql-server            x86_64          5.0.95-5.el5_9          installed           22 M
 perl-DBD-MySQL          x86_64          3.0007-2.el5            installed          328 k

Transaction Summary
==========================================================================================
Remove        4 Package(s)
Reinstall     0 Package(s)
Downgrade     0 Package(s)

Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
Running rpm_check_debug
Running Transaction Test
Finished Transaction Test
Transaction Test Succeeded
Running Transaction
  Erasing        : mysql-server                                                       1/4
  Erasing        : mysql                                                              2/4
  Erasing        : perl-DBD-MySQL                                                     3/4
  Erasing        : mysql                                                              4/4

Removed:
  mysql.i386 0:5.0.95-5.el5_9                mysql.x86_64 0:5.0.95-5.el5_9

Dependency Removed:
  mysql-server.x86_64 0:5.0.95-5.el5_9        perl-DBD-MySQL.x86_64 0:3.0007-2.el5

Complete!

アンインストールはこれで完了。

yumでMySQLをインストールしようとしたのだけど、

yum list updates --enablerepo=remi,epel,ius | grep mysql

とやっても何も表示されない。grepを付けずに確認したら

yum list updates --enablerepo=remi,epel,ius
Updated Packages
crash.x86_64                                    5.1.8-3.el5.centos                 updates
curl.x86_64                                     7.29.0-19.el5.remi                 remi
fail2ban.noarch                                 0.8.14-1.el5                       epel
firefox.i386                                    31.5.3-1.el5.centos                updates
firefox.x86_64                                  31.5.3-1.el5.centos                updates
kernel.x86_64                                   2.6.18-402.el5                     updates
kernel-devel.x86_64                             2.6.18-402.el5                     updates
kernel-headers.x86_64                           2.6.18-402.el5                     updates
ksh.x86_64                                      20100621-24.el5_11                 updates
lua.x86_64                                      5.1.4-4.el5                        epel
lzop.x86_64                                     1.03-2.el5                         epel
openvpn.x86_64                                  2.3.6-1.el5                        epel
perl-Crypt-OpenSSL-Random.x86_64                0.04-7.el5                         epel
perl-Crypt-PasswdMD5.noarch                     1.3-2.el5                          epel
perl-Email-Date-Format.noarch                   1.002-4.el5                        epel
perl-Error.noarch                               1:0.17010-1.el5                    epel
perl-Mail-SPF.noarch                            2.007-1.el5                        epel
perl-Pod-Escapes.noarch                         1.04-5.el5                         epel
perl-Razor-Agent.x86_64                         2.85-1.el5                         epel
perl-version.x86_64                             1:0.7203-1.el5                     epel
pkcs11-helper.x86_64                            1.11-3.el5                         epel
sendmail.x86_64                                 8.13.8-10.el5_11                   updates
sendmail-cf.x86_64                              8.13.8-10.el5_11                   updates
tzdata.x86_64                                   2015b-1.el5                        updates

ということで、リポジトリにMySQLが入ってない。

しょうがないのでJAISTのミラーサイトからMySQL関連のファイルを手動ダウンロードする。

MySQL-shared-compat-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
MySQL-client-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
MySQL-devel-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
MySQL-server-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm

wget http://ftp.jaist.ac.jp/pub/mysql/Downloads/MySQL-5.6/MySQL-shared-compat-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
--2015-03-30 17:49:13--  http://ftp.jaist.ac.jp/pub/mysql/Downloads/MySQL-5.6/MySQL-shared-compat-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
ftp.jaist.ac.jp をDNSに問いあわせています... 150.65.7.130, 2001:df0:2ed:feed::feed
ftp.jaist.ac.jp|150.65.7.130|:80 に接続しています... 接続しました。
HTTP による接続要求を送信しました、応答を待っています... 200 OK
長さ: 5199239 (5.0M) [application/octet-stream]
`MySQL-shared-compat-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm' に保存中

100%[================================================>] 5,199,239   3.15M/s 時間 1.6s

2015-03-30 17:49:15 (3.15 MB/s) - `MySQL-shared-compat-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm' へ保存完了 [5199239/5199239]

[masaru@ns ~]$ wget http://ftp.jaist.ac.jp/pub/mysql/Downloads/MySQL-5.6/MySQL-client-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
--2015-03-30 17:50:02--  http://ftp.jaist.ac.jp/pub/mysql/Downloads/MySQL-5.6/MySQL-client-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
ftp.jaist.ac.jp をDNSに問いあわせています... 150.65.7.130, 2001:df0:2ed:feed::feed
ftp.jaist.ac.jp|150.65.7.130|:80 に接続しています... 接続しました。
HTTP による接続要求を送信しました、応答を待っています... 200 OK
長さ: 23191064 (22M) [application/octet-stream]
`MySQL-client-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm' に保存中

100%[================================================>] 23,191,064  2.77M/s 時間 7.4s

2015-03-30 17:50:10 (3.00 MB/s) - `MySQL-client-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm' へ保存完了 [23191064/23191064]

[masaru@ns ~]$ wget http://ftp.jaist.ac.jp/pub/mysql/Downloads/MySQL-5.6/MySQL-devel-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
--2015-03-30 17:50:40--  http://ftp.jaist.ac.jp/pub/mysql/Downloads/MySQL-5.6/MySQL-devel-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
ftp.jaist.ac.jp をDNSに問いあわせています... 150.65.7.130, 2001:df0:2ed:feed::feed
ftp.jaist.ac.jp|150.65.7.130|:80 に接続しています... 接続しました。
HTTP による接続要求を送信しました、応答を待っています... 200 OK
長さ: 4589592 (4.4M) [application/octet-stream]
`MySQL-devel-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm' に保存中

100%[================================================>] 4,589,592   2.71M/s 時間 1.6s

2015-03-30 17:50:42 (2.71 MB/s) - `MySQL-devel-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm' へ保存完了 [4589592/4589592]

[masaru@ns ~]$ wget http://ftp.jaist.ac.jp/pub/mysql/Downloads/MySQL-5.6/MySQL-server-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
--2015-03-30 17:51:08--  http://ftp.jaist.ac.jp/pub/mysql/Downloads/MySQL-5.6/MySQL-server-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
ftp.jaist.ac.jp をDNSに問いあわせています... 150.65.7.130, 2001:df0:2ed:feed::feed
ftp.jaist.ac.jp|150.65.7.130|:80 に接続しています... 接続しました。
HTTP による接続要求を送信しました、応答を待っています... 200 OK
長さ: 88596822 (84M) [application/octet-stream]
`MySQL-server-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm' に保存中

100%[================================================>] 88,596,822  3.35M/s 時間 28s

2015-03-30 17:51:36 (3.03 MB/s) - `MySQL-server-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm' へ保存完了 [88596822/88596822]

ダウンロードしたMySQL5.6.23をインストールする。順番を違えると依存性云々と言われる可能性があるので、この通りにするのが良いらしい。

sudo rpm -ivh MySQL-shared-compat-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
[sudo] password for masaru:
準備中...                ########################################### [100%]
   1:MySQL-shared-compat    ########################################### [100%]
[masaru@ns ~]$ sudo rpm -ivh MySQL-client-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
準備中...                ########################################### [100%]
   1:MySQL-client           ########################################### [100%]
[masaru@ns ~]$ sudo rpm -ivh MySQL-devel-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
準備中...                ########################################### [100%]
   1:MySQL-devel            ########################################### [100%]
[masaru@ns ~]$ sudo rpm -ivh MySQL-server-5.6.23-1.rhel5.x86_64.rpm
準備中...                ########################################### [100%]
   1:MySQL-server           ########################################### [100%]

MySQLのバージョンを確認する。

mysql --version
mysql  Ver 14.14 Distrib 5.6.23, for Linux (x86_64) using  EditLine wrapper

これでMySQL 5.6.23にアップグレードできた。
と思ったが、

mysql -u root -p
Enter password:
ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/var/lib/mysql/mysql.sock' (13)

と、socketに関する通信エラーが出てしまう。

さて、どうしたもの。

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